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La construction d’une séquence génomique de référence unique par espèce a beaucoup apporté dans l’analyse du génome, de sa diversité et de son fonctionnement. Mais elle donne une représentation incomplète de la diversité des génomes au sein d’une espèce… En permettant la production de fragments de séquence de plus grande longueur, les nouvelles technologies de séquençage vont permettre d’aller plus loin dans la connaissance des génomes de chaque espèce…
Cedric's insight:
voir aussi La génomique au service de la santé animale https://sco.lt/5o1tXF 
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Le génotypage permet en effet de repérer parmi les gènes de l'animal ceux qui vont garantir les caractéristiques indispensables pour l'éleveur: croissance, morphologie, potentiel laitier et gène sans corne qui permet d'éviter d'avoir à écorner les vaches. Cela permet également de redresser certaines dérives de la sélection: "avec la hausse du rendement laitier il y a eu une baisse de la fertilité", et une baisse de la variabilité génétique...
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La vache est le produit d’un long travail d’observation et de sélection. De spécialisation aussi... En France aujourd’hui, La Prim’Holstein, issue de la Frisonne pie-noir elle-même descendante de la Hollande, occupe le haut du pavois.Et avec elle, sept autres races suffisent dorénavant à constituer… 96% des effectifs. Pour répondre à la demande de masse, une tendance de l’élevage est de tirer encore vers leur exploitation plus rationalisée encore. Des fermes de 300, 500, 1000 vaches et, au bout du processus de transformation, des briquettes de lait qui circulent en conteneurs… Et pendant ce temps, en novembre 2015 s’est éteinte la dernière des Bazougers tandis qu’étaient mortes auparavant, dans une obscurité plus grande encore, la brune de Guingamp et tant d’autres. La lutte des races à petits effectifs pour maintenir leur existence mérite aussi l’éclairage. Jacques Chirac parlait de chefs d’œuvre à propos des limousines. Dans le cheptel bovin, il est aussi bien des chefs d’œuvre en péril. Via IDELE Institut de l'Elevage
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Intervention de Romain_Saintilan : développement du calcul d'index génomique en bovins lait" by idele on Vimeo
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